巫门的结构总的来说，不过三类，除去巫师，也就是巫神以及巫众了。
巫神，是巫门与天庭对抗的关键。普通的巫神与天神天仙同级，而强横一点的巫神，凝聚大巫印，便可与神君金仙等同，借助巫印，巫神也可就此掌控天地元力，统御天地法则。那些最强横的大巫便是与大罗金仙已经尊神相媲美。甚至要是战力强大了，几乎可以赶上准圣了。
而在往上，大巫之上便是巫祖了。十二巫祖执掌祖巫印，这才是巫祖的核心权柄所在。
但是谁让共工那厮犯二呢！由于业力缠身，天罚降临，共工一脉的大巫印，威力直接消减了三成。便是共工本身的祖巫印也被天谴击碎，消散于天地。不然要是共工的祖巫印尚在，继承共工巫祖的位置，那里有这么麻烦。直接从共工后嗣中选取一位，直接继承祖巫印就好了。
说到这，就不得不提一句后土部落的后稷，作为后土巫祖选定的接班人，拒绝直接继承后土的祖巫印，而是决定凭借自己的力量，将自己的大巫印，演变成祖巫印。
而事实上，到现在，这位也的确厉害，已经达到半步巫祖的境界，已经可以顶替后土布阵都天神煞了。只需从后土的祖巫印中，参悟盘古烙印，也就可以晋升巫祖了。
盘古烙印便是十二巫祖的力量来源，当初十二巫祖曾经得到过一枚盘古烙印，由此这些巫祖才会自称为盘古后裔，由此将这烙印一分十二，化作十二枚祖巫印，才有了十二巫祖的诞生。
盘古烙印，乃是盘古神魂碎片所形成的烙印，其中包含盘古的意志，得到一枚盘古烙印便可视之为，天地正统一脉，传承盘古气运。但是这种瑰宝可遇不可求。洪荒，算上太古上古两个大时代，已知的盘古烙印也不过几枚而已，也都纷纷有主了。便是女娲这种圣人也没有这种东西。
相较于后稷，共工的后嗣明显就差了许多，还有杀死所有的共工血裔，就此促敛精血，再利用共工当初逸散的精气磨练肉身，比后稷可是差远了。
巫神除了那巫印值得称道，血脉也是一个很重要的关键。巫神的血脉传自于那些先天大神或者他们本身便是先天所化的神祇。这些先天神祇都是传自与盘古的嫡传一脉。
在盘古开辟之后，除了龙凤等极少数的神圣借助混沌之气化形，算是半个盘古族裔。其他的神祇生灵都是盘古后裔。
当初太古三皇，伏羲女娲，东皇三清，接引准提，乃至十二巫祖都是盘古的后裔。
但是这其中也就有远近之分了。像太古三皇无论是哪一个，都是一时无两，风华绝代的人物。他们可说是正儿八经的盘古化身。
而后，天皇精气落于太阳星而成东皇太一。地皇精气沉与大地才有了后土地祇。人皇精气也是出了一位九皇真母以及河伯元馗。
而像三清便是盘古精气逸散，所化的玄、元、始而成。此三气又为混洞太无元、赤混太无元以及冥寂玄通元三气而成。
冥寂玄通元玄白之气，幻化神宝，衍化太清，乃是太清道德天尊。混洞太无元青始之气，幻化天宝，衍化玉清，而成玉清元始天尊。赤混太无元玄黄之气，幻化灵宝，衍化上清，即为上清灵宝天尊。
此三位先后拜入先天混元一气化生的鸿钧道人门下，修行大道。而后太清道人开辟大赤天，执掌太极；玉清道人开辟清微天，执掌两仪；上清道人开辟禹余天，执掌四象。三圣演化三十六天圣境，为此玄门一门四圣镇压洪荒。
而接引准提也是西方先天神祇，借助莲花，菩提而生。但是相较于直接传承盘古的太古三皇，神族一脉，以及那盘古精气所化的三清，明显就算不得盘古一脉嫡传了。
至于十二巫祖，像后土便是当初地皇精气化身，祝融共工等人便是太古五方神族中的水火神族出身。
而烛九阴和那位开天辟地之初诞生的烛龙大神不清不楚。帝江等人是天生的神祇，先天道体生成。至于奢比尸这位瘟疫疾病的神祇，半是先天半是后天，既是应允先天法则运数而成生的神祇，同时也是因为众生的祈愿而诞生。这十二位巫祖掌控十二地煞地支，根据盘古烙印，演练十二都天。在天庭一脉，又被称为十二魔神。
而其他巫神，要么是巫祖的后裔属神，要么是巫祖收复的先天神祇，再要么便是那些先天神祇的后裔，可是不管怎么说，归根究底，巫神一脉都是那盘古神的嫡系，神性不灭，就此传承。
于是，这便是巫神最诟病帝俊的地方。帝俊作为星神一脉，天神化生，可是正经的先天神祇。但是却跟那些妖神不清不楚。
那些妖神是什么，那可都是湿生卵化，后天阴阳而出的蝼蚁之辈啊，对于这些先天神祇以及他们的后裔来说，自然瞧他们不起。不愿意与这些妖神并立了，于是才有了最初的巫妖之争。
而除去巫神，巫师，第三类便是一般的巫众了。这些巫众也有所区分。最上等的自然是那些巫神的血裔，这些神祇的后裔，天生便有半神的力量，说是巫众也是未来的巫神候选。其次是一般巫族，这些都是巫神的部族所属，巫神的信众巫师便是从此选拔而出，他们的家人也都被归诸于这类。而最次的，便是那巫门降服的附属种族了。
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