六人顺利的来到了海面，接着便是小智派了比比鸟出去寻找大陆，但比比鸟雀将火箭队三人组给叼了回来，就这样众人在海上漂了很久，大家的肚子都饿了，小飞就将之前打包的食物拿了出来分给了大家，火箭队三人组也想吃，作为交换火箭队不能妨碍小飞他们。之后小次郎觉得鲤鱼王没用就一脚将鲤鱼王踹下海，鲤鱼王非常愤怒从而进化成了暴鲤龙。小霞见此非常慌张，想要派出神奇宝贝逃走却被小飞拦下，“小飞你干什么？暴鲤龙就要攻过来了，我们快逃啊！”小霞焦急的喊道。“放心，交给我。”小飞说完放出了大嘴雀，“姐姐，话说自从大嘴雀进化后小飞就一直喜欢让它出来战斗呢！这样不就冷落了其他的神奇宝贝嘛！你看伊布那一脸伤心状，”小雨已经不再像之前一样脸红红的，小声地对着蜜柑说道。“是啊！”蜜柑说道。
“大嘴雀，十万伏特。”小飞下令道。大嘴雀大叫一声打出了十万伏特准确的命中了暴鲤龙效果拔群。暴鲤龙大吼一声想着大嘴雀喷出了一道巨大的水柱，“大嘴雀，影子分身，然后打雷。”大嘴雀使出了影子分身躲开了水炮，紧接着大嘴雀使出了打雷再一次的命中了暴鲤龙，可还是没让暴鲤龙失去战斗能力，暴鲤龙晃了晃自己的脑袋，然后怒视着大嘴雀，嘴中发出了黄色的光束，是破坏死光。“大嘴雀避开，然后使出燕返。”小飞说道。大嘴雀一个回旋避开了破坏死光，然后使出了燕返冲向了暴鲤龙，暴鲤龙自知自己躲不过，于是便开启了亿万吨冲击波和大嘴雀相撞，结果大嘴雀被亿万吨冲击波巨大的威力撞离了数十米，受到了很大的伤害，而暴鲤龙则因为体力耗尽倒在了水面上。“呼，终于搞定了，小雨，快点将暴鲤龙收服吧！”小飞对着小雨说道。“啊！你说什么？将暴鲤龙给我？”小雨惊讶道。“是啊！你现在的实力还很弱，所以这只暴鲤龙理应给你，这样可以增强你的实力。”小飞说道。“这样啊！那谢谢了小飞。”小雨美丽的小脸微微的变红，感谢完小飞后便抛出了神奇宝贝球将暴鲤龙收服了。接着小雨将暴鲤龙放了出来并给其治疗，而暴鲤龙醒来后并没有对小雨发怒而是乖乖的接受小雨的治疗，看来暴鲤龙非常喜欢小雨。
接着小飞让大嘴雀找到了城镇，然后众人便让水系神奇宝贝载着他们朝城镇进发，很快便来到了蓝普尔其市。“回到陆地的感觉真好啊！”小智感慨。上了陆地后火箭队三人组便跑开了，准确来说是逃走了。接着小智三人组也和小飞三人分开了。
来到海边令人想到的就是度假了，所以小雨和蜜柑一下换上了泳装在海滩边嬉戏。而小飞则来到了神奇宝贝中心，再将神奇宝贝们交给乔伊后和大木博士打了电话，可接电话的是正辉博士，然后小飞向正辉博士要了一个超重球再聊了几句后便挂断了电话，然后拿着恢复好的伊布等神奇宝贝来到海边和小雨蜜柑一起玩了起来。接着三人觉得肚子饿了，便来到了一家餐厅吃东西，结果就遇到了小智等人正在那家餐厅打工，原因就不说了，相信大家都懂得。之后小智三人接受小雨的建议很快令原本冷清的餐厅热闹了起来，但好景不长，火箭队的人来捣乱，人全走光了，之后便是小智妈和大木博士出现。“大木博士，我姐姐呢！”小飞问道。“你姐姐啊！还在饭店里忙呢！”大木博士见小飞说道。“姐姐真是的，只知道忙，都不知道休息。”小飞抱怨道。然后小智的妈妈提出了举办沙滩美女选美大赛的想法。小雨蜜柑小霞都去参加了，然后小茂也带着美女军团出现。
比赛进行到一半，火箭队驾驶着机械暴鲤龙出场，小飞对此毫无兴趣，这些事交给小智就行了，自己则在一旁训练起了神奇宝贝。很快火箭队便被打飞了，而比赛也结束了，冠军不用说自然是小智的妈妈。而小智他们也成功的还了债，只不过小雨小霞有点不高兴，而蜜柑则无所谓。晚上小飞调慢了闹钟，导致第二天早上三人误了通信船而小智三人也因为小智的贪睡没有上船。
而就在众人不知所措时小霞发现了原著中的那只墨海马，只见墨海马在海面上吐出了玛瑙水母和毒刺水母的墨汁，众人根本不知道墨海马的意思，小飞除外。然后小霞就将墨海马收服了。接着便是如剧情的那样玛瑙水母军团出现并开始袭击城市，然后银婆婆就出资1000000请人赶走玛瑙水母，结果有很多人派出了神奇宝贝对付玛瑙水母，但都被玛瑙水母打败。之后火箭队三人组登场并接下了赶走水母的工作，然后巨大的毒刺水母出现并开始破坏城市，想要赚钱的训练家都被吓跑了。“婆婆，如果我把那只巨大的毒刺水母搞定，你给我多少钱？”小飞问道。“如果你帮我赶走了那只巨大的水母，我就给你500000，怎么样啊婆婆？”“看我的吧！”小飞说完就冲向了巨大毒刺水母处，而小霞听了小飞的话都以为看错小飞了，想要上前找小飞理论，却被小雨拦了下来，说小飞这样做应该有自己的原因，小霞这才停下了脚步决定等事情平息后问小飞。
这时毒刺水母带着玛瑙水母军团来到了城市，“毒刺水母，和我一决胜负吧！我要收服你。”小飞喊道。毒刺水母听后大叫一声，好像不屑与小飞一战。“上次没能收服巨大快龙，这次一定要收服你。“小飞想着放出了所有的神奇宝贝。
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