除了军衔制外，兵部还修订了《苏褔省征兵制》，明确了西殿是征兵制和募兵制并轨实行的。这次经过整编之后的将士都算是募兵制下的常备职业军人，经后西殿野战军就是一支职业军人组成的军队，他们的薪俸、粮饷都是西王府提供，也就意味着他们成了西殿的兵马，这也打破了圣库供养的情况，士兵们也可以有私产了。
而征兵制则是针对乡兵制定的，乡间村坊的青壮凡是年满十八岁后，就有加入地方乡兵部队服役三年的义务，三年后退伍，回地方务农。但每地的乡兵都有一个限额，也不一定所有十八岁的青壮都能当上乡兵。
萧云贵之所以选择募兵制和征兵制并行，是因为现在太平军还没有取得天下，而且列强还在虎视眈眈，他需要常备军队来作战。虽然募兵制将来可能成为国家沉重的负担，但萧云贵相信等到取得天下，列强的威胁也降低的时候，再改为征兵制，这样就不会有什么大问题了。
此外西殿兵部还颁布了《伤残捐躯将士照养章程》，西殿将士们伤残之后，西王府也是一样的照养，同时会安排伤残将士就业。捐躯的将士除了得到抚恤金之外，西王府还能分家属二十亩土地。这些都是职业兵能享受的待遇，而乡兵因为是义务兵，能享受的待遇就差了一些，但伤残捐躯之后也同样有保障。
最后就是兵部颁布的《西殿荣誉爵位章程》，这个章程里规定的则是爵位和一些荣誉称号和荣誉勋章的种类，以及获得勋章后可以享受到的待遇。爵位萧云贵依然采用了公侯伯子男五等爵位来奖励有功之人。称号当中有羽林卫、禁卫军、虎贲烈士等等军事性的荣誉称号，也有太师、太傅、太保、上卿、少卿等文事性的荣誉称号。勋章则是以汉家一些著名人物为名的勋章，如霍去病勋章、岳武穆勋章等等军事性勋章，也有如班超勋章、张良勋章等等文事性勋章。值得一提的是各行各业都有勋章，这些勋章是用来表彰各行各业涌现出来的人才，反正古代汉家各行各业有的是名人，直接用名人命名勋章即可。比如工匠们的勋章叫鲁班勋章，大夫们的勋章叫扁鹊勋章等等。
爵位和荣誉称号一旦获得，按照等级西王府会每年给予奖金或者其他免税政策，而勋章获得则是一次性奖励一笔钱财。这个手段更加丰富了奖赏功劳的手段，不像之前太平军中人人都是在圣库吃大锅饭，有功劳了大家都加官进爵，手段比较单一。这个章程颁行之后不但刺激了军队的荣誉感，也大大刺激了各行百业人等的上进之心，历朝历代何时明文规定会奖励辛苦的工匠、大夫等三教九流的人物？
此令颁行之后，萧云贵也直接便用，封赏了一批能臣旧将，不少跟随萧云贵的老将们被封为子爵、男爵不等，荣誉称号也是发了一批，萧云贵更加许诺，整编结束后，有突出功绩的会颁给第一批的勋章，萧云贵为了尽快完成整编，不介意下一阵勋章雨。
萧云贵选在这个时候颁布各种和军队有关的保障条令，也是本着打一个嘴巴，安抚一下的原则。让军队看到整编后可以拿到的好处，同时也用爵位安抚了一大批能臣旧将，让整编之事能更加顺利的进行下去。
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