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搞定了这一切之后，朱树人便请示了南京朝廷，准备把北伐的五十万大军，撤回二十万至南方，再分兵十万人往东沿海驻扎，比如驻在登来、天津等地，只在北方内陆不靠海的位置，留二十万作战部队，以减少军粮消耗，维持财政收支平衡，以利持久。
收复关内的难度，和北逐草原残寇的难度，远不是一个级别的，必须做好打持久战的准备。如果太急切，把自己吃崩了，再来一波崇祯时的流贼，那绝对是得不偿失。
南京的隆武帝朱常淓本就没什么雄图远略，这次能半年之内收复北京，他就已经很满意了。
至于朝官，最鹰派讲究大义名分的史可法，也觉得现在的立功进度已经足够快，所以全部通过，准许朱树人先撤一部分部队南下。
四月初八，朱常淓正式下旨，让朱树人领兵二十万暂且南归，并且带上主要立功将领，回南京述职表功，接受升赏，顺便奏对集议一下下一阶段的追击工作、具体该如何展开。
北方只留下一个河南兼北直隶总督张煌言，暂且主持新光复地区的安抚治理工作，继续剿匪扫除零散残敌。
另外，朱常淓也在旨意中，顺带宣布了对北京城内残留的宫室、宫廷珍宝、宦官宫女的处置意见。
北京紫禁城的后宫需要封存，不必修缮，暂时节省钱粮以示体恤民力，只要把烧毁破坏的残骸清理干净即可。
前朝部分，三大殿没有皇帝亲临，肯定是不能动用的，但左右偏殿、原六部衙门，都可以直接用于办公，还可以挪用一座殿宇作为北直隶总督的临时幕府。
毕竟有明一朝，原本在南北直隶都是不设总督的，也就没有总督办公的衙门，现在新设的官职，配套工作当然也要事急从权。
事实上，不重修被焚毁的紫禁城建筑，这也是没办法的事情，因为眼下根本就没有符合标准的材料供应，如果强行造，最后降低标准，损失的也是朝廷体面，那还不如不造。
历史上清朝初年，紫禁城很多宫室被焚毁后，可以有材料重修，一个重要的来源，就是明朝留下的十三陵——
从康熙到乾隆年间，中国大地上仅存的尺寸够大树龄够老、可以修皇宫的金丝楠木，已经完全不足了。清朝修紫禁城，很多金丝楠木，是打着“帮前朝修缮年久失修的十三陵”，然后用便宜的新木料给十三陵换上去，再把十三陵拆出来的金丝楠木老料子，用来修乾清宫。
但问题是现在大明回来了，历史上清朝能用的招、明朝统治者绝对是不能学的。总不能让朱家子孙自己把十三陵祖坟的木料拆了来造皇宫吧？这可是大逆、大不孝的罪名。
而只要不拆十三陵，整个华夏大地已经找不够金丝楠木再彻底按旧标准重修北京紫禁城了，有钱也解决不了。就算把一千万平方公里的国土整个翻过来，都没那么多金丝楠木大树。
另外，大明一贯是有南北两套六部班子的，只不过原本北京的六部是正式办事的，南京的六部是配套备胎。现在朝廷既然在南方办公了，北方完全不重设六部，也有点体面上说不过去。
所以朱常淓跟史可法商议后，决定在北京重设户部、兵部、工部，以就近筹备决策未来光复作战、进一步驱除鞑虏所需的事务。
因为要打仗，筹备钱粮军需、调兵遣将、配套基础设施建设的活儿，都是要尽快处理的，不能事事请示南京，回耽误。
至于北京的礼部、刑部、吏部，暂时就只留一个尚书虚衔的光杆司令好了，反正这三个部跟军机大事没关系。以示大明并没有放弃北京的陪都地位，也避免了一些人拿“违反祖宗之法”说事。
同时只留一个尚书，只给尚书发一份俸禄，也没多少钱，朝中自然有年高德劭事迹上却不便掌握实权的养老重臣去充任，算是非常实用主义的处理方式，既没花钱也不用打嘴仗。
把这些工作做完后，面子上就过得去了，朝廷重新迁回北京的事儿，就能慢慢从长计议，多拖几年也不会有人嚼舌头。
吩咐完北京紫禁城和六部的处置后，朱常淓诏书的最后部分，就是关于伪清内廷人员的安置。
朱常淓也不是什么好色之徒，就直接宣布，凡是伪清入关后新募集的宫女宦官，可以全部放出宫去，任其自由。
如果实在谋生有困难的，放出宫无法自己养活自己，也可以由当事人自己申请，赏赐给有功将领和宗室为婢妾或奴仆，一切都是自愿原则。
至于那些在皇宫中已经生活了七年以上的、也就是崇祯朝开始就已经在内宫中的宫女宦官，属于大明原本自己招的旧人，这些当然不能全部一脚踢开，否则有伤朝廷体面和仁德。
所以就区别对待，先甄别一下：
如果宦官有在这七年里主动讨好鞑子新主子、媚上求升迁的，也一律赶出宫去，有主动帮鞑子主子出主意残害同胞的，查实有证据更要处死，这没什么好说的。
如果宦官在这七年里没有媚上劣迹，没有得到满人重用升迁的，那大明肯定要留用，给他们一个养老，以示仁德。
宫女部分，被鞑子玷污过的，朱树人已经放出去了，朱常淓也觉得做得对。而那些没有被玷污过的，也要分年限，入宫七年以上的，是大明自己招的，只要不玷污，大明就要负责养老，被玷污过的，赏赐给将士们，也可以得养老。
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